2044年的纽约，大反派朗格勾结外星恶势力试图毁灭地球，大量外星人通过神秘传送门入侵，将城市化为灰烬。忍者神龟们虽负隅顽抗仍不敌敌人攻势，死伤惨重。怀抱着忍者最强武器——希望，忍者神龟们决定回到过去时空，找到开启传送门的钥匙，阻止朗格，恢复世界和平。莱昂纳多的弟子凯西肩负起这一使命，他在过去时空与女记者艾普奥尼尔成功接头，并和忍者神龟莱昂纳多、米开朗基罗、拉斐尔、多纳泰罗汇合，开启了拯救世界的行动。“我们的未来，我们自己做主”，忍者神龟们向朗格发起了终极挑战。
演员：史蒂夫·马丁 伊扎克·帕尔曼 昆西·琼斯 贝特·米德勒 詹姆斯·厄尔·琼斯 佩恩·吉列特 特勒 詹姆斯·莱文 安吉拉·兰斯伯瑞 韦恩·艾尔温 托尼·安塞尔莫 露西·泰勒
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演员：莎拉·斯努克 柯蒂·斯密特-麦菲 杰基·韦佛 艾瑞克·巴纳 多米尼克·皮侬 尼克·凯夫 玛格达·苏班斯基 亚当·艾略特 Lee Yee Flynn Wandin Saxon Wright Bernie Clifford 安迪·赖特 Klaus Banadinovich Tony Armstrong Luke Elliot Paul Capsis Owen Grieve Davey Thompson 罗杰·萨维奇
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